dnaman

DNAMAN 2026官方版是由 LynnonBiosoft 公司精心研发的一款序列分析工具。它堪称一款高度集成化的分子生物学应用软件，功能强大到几乎能完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作，像多重序列比对、PCR 引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析以及质粒绘图等任务都不在话下。凭借其出色的速度、强大的多功能性、极高的准确性以及高质量的表现，DNAMAN 已然成为每位分子生物学家值得信赖的基本工具之一。在众多同行评审的科学期刊中，DNAMAN 9 作为被高度引用的序列分析软件脱颖而出。对于大学、研究机构、实验室以及研究科学家们而言，它无疑是首选的序列分析软件。

软件特色

1. 序列编辑与转化：支持 DNA 和蛋白质序列的编辑操作，还能对 DNA 序列进行灵活转化。

2. 多序列比对与深度分析：可进行多序列比对，并对对齐结果进行细致编辑和深入分析。

3. 系统树与点阵比较：具备系统树分析功能，还能对 DNA 或蛋白质序列进行点阵比较。

4. 序列组装与网络搜索：能够完成 DNA 序列的组装和编辑工作，通过 BLAST 借助网络界面在 Intranet/Internet Server 上展开搜索。

5. 增强型图案搜索与特色工具：支持序列和数据库中的增强型图案搜索，拥有 SiRNA 选择器等特色工具。

6. 限制分析与绘图：可进行限制分析、限制模式预测，还能绘制出达到出版品质的序列图。

7. 克隆与突变分析：实现电子克隆，能从限制片段重建限制图，进行静音突变分析以创建或破坏限制性位点，还能通过导向不匹配来创建或破坏限制站点。

8. 蛋白质深度分析：涵盖翻译和密码子使用分析、蛋白质疏水性/亲水性分析、蛋白质表征（包括等电点的序列组成和预测）、蛋白质二级结构预测以及反向翻译等功能。

9. 引物设计与热力学表征：可设计 PCR 和测序引物，并能表征 DNA 或引物序列的热力学性质。

10. 分歧分析与数据库管理：支持分歧分析，能够管理寡核苷酸、DNA 和蛋白质数据库，还能生成随机序列。

DNAMAN 使用教程

1. 软件启动与新建：打开在本站下载好的 DNAMAN 软件，点击软件顶部的“File”，在弹出的选项中选择“new”。

2. 输入 DNA 序列：在新建好的对话框中准确输入所需的 DNA 序列。

3. 序列选中：输入完成后，同时按住键盘上的“Ctrl”和“A”键，选中输入的序列，然后单击软件顶部“seq”（图中已标注）。

4. 获取反向互补序列：点击软件顶部的“Sequence”选项，在弹出的选项中依次点击“Display”，在二级菜单中点击“Rev.Compl.Sequence”，即可得到原序列的反向互补序列。

功能介绍

1. 数据库管理便捷开启：选择“数据库|经理”命令，即可打开“数据库管理器”对话框，方便用户对数据库进行管理操作。

2. 有序组织序列数据库：该软件的数据库功能十分强大，允许用户按照不同科目对 DNA 和蛋白质序列进行有序组织，使序列管理更加清晰高效。

3. 灵活编辑记录信息：关于特定记录的信息可以进行自由编辑。在序列列表框中，所有记录会按照字母顺序或记录顺序依次列出，每个记录名字旁边显示记录号 ID，该 ID 由 DNAMAN 自动分配，因此用户可以为不同记录使用相同名称。

4. 高效扫描序列相似性：它能够扫描默认数据库中所有序列记录，搜索当前序列的同源序列。若默认数据库包含 DNA 序列，则默认序列必须为 DNA 序列；若默认数据库包含蛋白质序列，则默认序列必须为蛋白质序列。DNAMAN 会采用快速对准方法扫描数据库的序列相似性，用户还可根据需求选择对结果最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式。

5. 精准错配分析：错配分析功能旨在找出 DNA 序列引物的所有可能退火位点，在默认设置下，此功能可用于 PCR 和 DNA 测序的引物选择。通过权重矩阵来区分引物位置的重要性，由于引物在 3’末端对目标 DNA 的匹配比 PCR 扩增的 5’末端更为重要，所以会赋予 3’末端更多权重。为提高 PCR 引物的特异性，用户应始终检查引物与靶 DNA 之间是否存在次级退火位点。